Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kcnip4Q6PHZ8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnip4Q6PHZ8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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