Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc57Q6PHN1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc57Q6PHN1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms