Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Taf1cQ6PDZ2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Taf1cQ6PDZ2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms