Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chd4Q6PDQ2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chd4Q6PDQ2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Chd4Q6PDQ2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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