Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM1

Msl1, Male-specific lethal 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl1Q6PDM1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msl1Q6PDM1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msl1Q6PDM1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msl1Q6PDM1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msl1Q6PDM1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msl1Q6PDM1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msl1Q6PDM1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Msl1Q6PDM1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Msl1Q6PDM1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msl1Q6PDM1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msl1Q6PDM1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Msl1Q6PDM1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msl1Q6PDM1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msl1Q6PDM1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msl1Q6PDM1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msl1Q6PDM1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msl1Q6PDM1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msl1Q6PDM1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msl1Q6PDM1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msl1Q6PDM1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msl1Q6PDM1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msl1Q6PDM1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msl1Q6PDM1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msl1Q6PDM1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Msl1Q6PDM1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msl1Q6PDM1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msl1Q6PDM1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Msl1Q6PDM1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Msl1Q6PDM1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msl1Q6PDM1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msl1Q6PDM1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msl1Q6PDM1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msl1Q6PDM1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msl1Q6PDM1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msl1Q6PDM1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Msl1Q6PDM1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msl1Q6PDM1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msl1Q6PDM1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msl1Q6PDM1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msl1Q6PDM1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msl1Q6PDM1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msl1Q6PDM1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Msl1Q6PDM1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msl1Q6PDM1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msl1Q6PDM1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msl1Q6PDM1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msl1Q6PDM1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Msl1Q6PDM1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msl1Q6PDM1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Msl1Q6PDM1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Msl1Q6PDM1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms