Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zbtb39Q6PDK0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zbtb39Q6PDK0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zbtb39Q6PDK0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Zbtb39Q6PDK0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbtb39Q6PDK0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zbtb39Q6PDK0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zbtb39Q6PDK0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbtb39Q6PDK0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbtb39Q6PDK0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbtb39Q6PDK0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbtb39Q6PDK0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbtb39Q6PDK0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbtb39Q6PDK0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbtb39Q6PDK0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb39Q6PDK0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb39Q6PDK0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb39Q6PDK0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms