Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms