Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gapvd1Q6PAR5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gapvd1Q6PAR5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gapvd1Q6PAR5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms