Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
BC061212Q6P8K3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BC061212Q6P8K3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms