Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rrp12Q6P5B0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp12Q6P5B0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms