Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpbp1l1Q6NZP2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpbp1l1Q6NZP2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms