Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Soga3Q6NZL0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Soga3Q6NZL0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Soga3Q6NZL0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms