Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rprd2Q6NXI6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rprd2Q6NXI6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.8 ms