Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Colgalt2Q6NVG7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Colgalt2Q6NVG7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms