Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SphkapQ6NSW3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SphkapQ6NSW3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms