Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sohlh1Q6IUP1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sohlh1Q6IUP1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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