Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tpm4Q6IRU2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tpm4Q6IRU2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tpm4Q6IRU2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tpm4Q6IRU2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tpm4Q6IRU2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tpm4Q6IRU2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm4Q6IRU2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm4Q6IRU2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm4Q6IRU2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm4Q6IRU2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm4Q6IRU2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm4Q6IRU2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm4Q6IRU2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm4Q6IRU2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm4Q6IRU2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm4Q6IRU2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm4Q6IRU2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm4Q6IRU2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm4Q6IRU2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm4Q6IRU2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm4Q6IRU2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm4Q6IRU2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm4Q6IRU2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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