Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q6GQU0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q6GQU0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q6GQU0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q6GQU0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q6GQU0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q6GQU0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q6GQU0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms