Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf8Q6DID3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms