Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC6

Tro, Tro protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TroQ6DIC6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TroQ6DIC6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
TroQ6DIC6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TroQ6DIC6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TroQ6DIC6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TroQ6DIC6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TroQ6DIC6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TroQ6DIC6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TroQ6DIC6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TroQ6DIC6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TroQ6DIC6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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