Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIA9

Fbxo27, F-box only protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo27Q6DIA9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fbxo27Q6DIA9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbxo27Q6DIA9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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