Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nop58Q6DFW4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms