Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc3c1Q6DFV6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc3c1Q6DFV6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc3c1Q6DFV6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc3c1Q6DFV6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Fndc3c1Q6DFV6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc3c1Q6DFV6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc3c1Q6DFV6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc3c1Q6DFV6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc3c1Q6DFV6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc3c1Q6DFV6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc3c1Q6DFV6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc3c1Q6DFV6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc3c1Q6DFV6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc3c1Q6DFV6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc3c1Q6DFV6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc3c1Q6DFV6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc3c1Q6DFV6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc3c1Q6DFV6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc3c1Q6DFV6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc3c1Q6DFV6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc3c1Q6DFV6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc3c1Q6DFV6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc3c1Q6DFV6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms