Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cep290Q6A078 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Cep290Q6A078 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cep290Q6A078 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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