Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msl2Q69ZF8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.3 ms