Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z66

Mysm1, Histone H2A deubiquitinase MYSM1, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mysm1Q69Z66 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mysm1Q69Z66 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mysm1Q69Z66 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms