Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF8

Rapgefl1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgefl1Q68EF8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rapgefl1Q68EF8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rapgefl1Q68EF8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rapgefl1Q68EF8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rapgefl1Q68EF8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rapgefl1Q68EF8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rapgefl1Q68EF8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rapgefl1Q68EF8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rapgefl1Q68EF8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rapgefl1Q68EF8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rapgefl1Q68EF8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rapgefl1Q68EF8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgefl1Q68EF8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgefl1Q68EF8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgefl1Q68EF8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgefl1Q68EF8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgefl1Q68EF8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgefl1Q68EF8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgefl1Q68EF8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgefl1Q68EF8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgefl1Q68EF8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgefl1Q68EF8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rapgefl1Q68EF8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rapgefl1Q68EF8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rapgefl1Q68EF8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Rapgefl1Q68EF8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rapgefl1Q68EF8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgefl1Q68EF8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rapgefl1Q68EF8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgefl1Q68EF8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgefl1Q68EF8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgefl1Q68EF8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgefl1Q68EF8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgefl1Q68EF8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgefl1Q68EF8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgefl1Q68EF8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgefl1Q68EF8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms