Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab3ipQ68EF0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab3ipQ68EF0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms