Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clcn1Q64347 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn1Q64347 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms