Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Surf4Q64310 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Surf4Q64310 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms