Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifit1Q64282 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ifit1Q64282 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ifit1Q64282 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifit1Q64282 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifit1Q64282 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifit1Q64282 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifit1Q64282 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifit1Q64282 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifit1Q64282 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifit1Q64282 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifit1Q64282 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifit1Q64282 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifit1Q64282 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifit1Q64282 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifit1Q64282 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifit1Q64282 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifit1Q64282 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifit1Q64282 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifit1Q64282 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifit1Q64282 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifit1Q64282 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifit1Q64282 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms