Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou4f3Q63955 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms