Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ift52Q62559 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ift52Q62559 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms