Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcn3Q62471 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms