Protein–RNA interactions for Protein: Q62458

Gm20809, (clone BALB14N), mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20809Q62458 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20809Q62458 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20809Q62458 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20809Q62458 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20809Q62458 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20809Q62458 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20809Q62458 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20809Q62458 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20809Q62458 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20809Q62458 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20809Q62458 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20809Q62458 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20809Q62458 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20809Q62458 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20809Q62458 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20809Q62458 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20809Q62458 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20809Q62458 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20809Q62458 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm20809Q62458 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gm20809Q62458 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gm20809Q62458 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20809Q62458 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms