Protein–RNA interactions for Protein: Q62407

Speg, Striated muscle-specific serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 3,262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpegQ62407 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SpegQ62407 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SpegQ62407 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SpegQ62407 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SpegQ62407 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SpegQ62407 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SpegQ62407 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SpegQ62407 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SpegQ62407 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SpegQ62407 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SpegQ62407 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SpegQ62407 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SpegQ62407 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SpegQ62407 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SpegQ62407 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SpegQ62407 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SpegQ62407 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SpegQ62407 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SpegQ62407 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SpegQ62407 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SpegQ62407 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SpegQ62407 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SpegQ62407 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SpegQ62407 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SpegQ62407 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SpegQ62407 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SpegQ62407 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SpegQ62407 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SpegQ62407 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SpegQ62407 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SpegQ62407 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SpegQ62407 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SpegQ62407 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SpegQ62407 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SpegQ62407 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SpegQ62407 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SpegQ62407 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SpegQ62407 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SpegQ62407 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SpegQ62407 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SpegQ62407 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SpegQ62407 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SpegQ62407 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SpegQ62407 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SpegQ62407 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SpegQ62407 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SpegQ62407 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms