Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Supt6hQ62383 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Supt6hQ62383 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms