Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TrhQ62361 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TrhQ62361 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TrhQ62361 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TrhQ62361 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TrhQ62361 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TrhQ62361 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TrhQ62361 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TrhQ62361 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TrhQ62361 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TrhQ62361 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TrhQ62361 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TrhQ62361 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TrhQ62361 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms