Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf6Q62311 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms