Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sycp1Q62209 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms