Protein–RNA interactions for Protein: Q62203

Sf3a2, Splicing factor 3A subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a2Q62203 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3a2Q62203 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms