Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim27Q62158 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim27Q62158 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim27Q62158 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms