Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EsrrbQ61539 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms