Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BcanQ61361 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BcanQ61361 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BcanQ61361 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BcanQ61361 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BcanQ61361 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BcanQ61361 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BcanQ61361 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BcanQ61361 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BcanQ61361 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BcanQ61361 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BcanQ61361 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BcanQ61361 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BcanQ61361 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
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