Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nell2Q61220 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nell2Q61220 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nell2Q61220 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nell2Q61220 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nell2Q61220 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nell2Q61220 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nell2Q61220 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nell2Q61220 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nell2Q61220 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nell2Q61220 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nell2Q61220 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nell2Q61220 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nell2Q61220 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nell2Q61220 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nell2Q61220 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nell2Q61220 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nell2Q61220 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nell2Q61220 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nell2Q61220 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nell2Q61220 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nell2Q61220 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nell2Q61220 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Nell2Q61220 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nell2Q61220 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nell2Q61220 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nell2Q61220 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms