Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trpc1Q61056 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc1Q61056 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms