Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxg1Q60987 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Foxg1Q60987 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms