Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
JrkQ60976 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
JrkQ60976 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
JrkQ60976 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
JrkQ60976 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
JrkQ60976 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
JrkQ60976 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
JrkQ60976 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
JrkQ60976 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
JrkQ60976 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
JrkQ60976 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
JrkQ60976 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
JrkQ60976 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
JrkQ60976 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
JrkQ60976 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms