Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rbbp7Q60973 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbbp7Q60973 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms