Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp4Q60972 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp4Q60972 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms